Необходимо удостовериться, что это действительно задвоенный НФДЛ, а, например, не НДФЛ за другой период. После этого можно удалить лишнюю строку в документе "Перенос данных". Но повторюсь еще раз: необходимо предварительно все проверить и постараться выяснить причину по которой эта запись задвоилась. Возможно у вас была какая-то ошибка в ЗиК.